Günümüze sirkehane adıyla ulaşmış olan binanın 19. yüzyıl sonları, ile 20. yüzyıl başları arasında bir Rum ailesi tarafından yaptırılmış olduğu tahmin edilmektedir. 1943 yılında T.C. Maliye Hazinesi'ne devrolan yapının arka kısmı 1960'lı yıllarda EÜ Ziraat Fakültesi Gıda ve Fermantasyon Teknolojisi Kürsüsü tarafından sirke ve turşu üretim yeri olarak, ön kısmı ise lojman olarak kullanılmıştır. 1990 yılında T.C. Maliye Hazinesi'nden Ege Üniversitesi'ne trampa yolu ile geçen sirkehane 1990'lı yıllara kadar konut olarak hizmet vermiştir.

Son 20 yıllık süreç içinde büyük bir bölümü yıkılmış olan bina, 2010 yılında tamamlanan restorasyon sonunda EÜ Balkanlar ve Anadolu Giysileri Müzesi olarak faaliyete geçmiştir. Müze Türkiye'de bir üniversite bünyesinde Kültür Bakanlığı ile ortaklaşa açılan ilk kurum müzesi olma özelliğini taşımaktadır.